科學(xué)家發(fā)明RNA測序新方法——檢測亞細(xì)胞水平轉(zhuǎn)錄組空間分布

斯坦福大學(xué)研究團(tuán)隊(duì)在RNA測序方面取得突破性進(jìn)展，發(fā)明了一種亞細(xì)胞水平轉(zhuǎn)錄組空間分布的RNA測序新方法，研究論文于近日在線發(fā)表于國際期刊Cell，論文標(biāo)題為“Atlas of subcellular RNA localization revealed by APEX-Seq”。

該研究發(fā)明了一種名為APEX-Seq的RNA測序技術(shù)，通過基因編碼的過氧化氫酶APEX2（engineered ascorbate peroxidase 2）經(jīng)過H2O2催化1分鐘后，直接在活細(xì)胞內(nèi)對指定區(qū)域（利用特異性融合蛋白或定位信號將APEX定位在目標(biāo)區(qū)域）的RNA進(jìn)行高精度的生物素標(biāo)記，利用親和素修飾的磁珠對標(biāo)記的RNA富集以進(jìn)行深度測序。該研究對包括細(xì)胞核、核孔、核纖層、核仁、細(xì)胞質(zhì)、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)外膜、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)內(nèi)膜、線粒體基質(zhì)、線粒體外膜在內(nèi)的9個(gè)亞細(xì)胞區(qū)域/結(jié)構(gòu)的RNA組成進(jìn)行了全面的分析，繪制了HEK293細(xì)胞內(nèi)以這9個(gè)位置為坐標(biāo)的轉(zhuǎn)錄組空間分布圖譜，以及細(xì)胞在不同刺激下部分區(qū)域RNA分布的動(dòng)態(tài)變化。 

科學(xué)家發(fā)現(xiàn)新療法可促進(jìn)腦卒中后血管再生

已知中風(fēng)后，抑制信號分子Nogo-A的抗體可以幫助修復(fù)受影響大腦區(qū)域的血管。近日，來自瑞士蘇黎世大學(xué)（UZH）的一個(gè)研究團(tuán)隊(duì)在小鼠模型中發(fā)現(xiàn)，它也能促進(jìn)運(yùn)動(dòng)功能的恢復(fù)。這項(xiàng)研究6月24日已發(fā)表在美國國家科學(xué)院院刊（PNAS）上，為治療開辟了新途徑。

在瑞士，每年約有1.6萬人中風(fēng)，全世界大約有1500萬人中風(fēng)。由于大腦再生受損組織和神經(jīng)回路的能力有限，導(dǎo)致三分之二的患者死亡或不能自理。目前，盡管進(jìn)行了大量的研究工作，但只有少數(shù)幾種藥物療法可以減少腦卒中后的嚴(yán)重后果。

一種頗有前景促進(jìn)生理功能恢復(fù)的新方法是修復(fù)受損腦區(qū)的血管系統(tǒng)。血管系統(tǒng)為受傷的組織提供氧氣和關(guān)鍵營養(yǎng)素。在中風(fēng)患者中，這種修復(fù)過程受到多種機(jī)制的抑制。幾年前，UZH大學(xué)Martin Schwab教授的研究小組使用了一個(gè)小鼠模型來證明，信號分子Nogo-A不僅能減少神經(jīng)纖維的生長，還能調(diào)節(jié)大腦中血管的生長，從而抑制它們的修復(fù)。

在一項(xiàng)針對小鼠的新研究中，研究人員對Nogo-A分子和其相應(yīng)的受體之一S1PR2進(jìn)行基因失活。這些小鼠的血管顯示出改善的再生能力，并且它們比對照組小鼠更好地恢復(fù)了受影響的運(yùn)動(dòng)技能。這些發(fā)現(xiàn)是在治療中得到了重現(xiàn)，在中風(fēng)后的小鼠中使用抗Nogo-A抗體，也使得在受影響的腦區(qū)周圍重建強(qiáng)大且功能性的血管網(wǎng)絡(luò)。

研究第一作者、UZH神經(jīng)科學(xué)家Ruslan Rust說，“接受治療的小鼠，其神經(jīng)系統(tǒng)顯示出更好的恢復(fù)能力，它們的運(yùn)動(dòng)功能受影響較小，我們將其歸因于血管再生?！?/span>

以前的增強(qiáng)血管生長的實(shí)驗(yàn)幾乎完全集中在血管生長因子的補(bǔ)充，由于其嚴(yán)重的副作用，如出血風(fēng)險(xiǎn)增加，導(dǎo)致這種方法在臨床上是不可行的。

Rust說：“我們的發(fā)現(xiàn)為治療中風(fēng)患者提供了一個(gè)很有前景的替代方法，尤其是因?yàn)榭筃ogo-A抗體已被用于脊髓損傷的臨床試驗(yàn)?！?/span>

美國約翰霍普金斯大學(xué)開發(fā)出腫瘤“液體活檢”新方法

腫瘤無創(chuàng)診斷技術(shù)，即液體活檢（liquid biopsies）的出現(xiàn)，標(biāo)志著人類在攻克腫瘤的道路上又前進(jìn)了一大步。日前，來自美國約翰霍普金斯醫(yī)院的團(tuán)隊(duì)在Nature發(fā)文，論文標(biāo)題為“Genome-wide cell-free DNA fragmentation in patients with cancer”，介紹了一種新型的腫瘤液體活檢技術(shù)。

外周血游離DNA（circulating fragment DNA, cfDNA）檢測是液體活檢技術(shù)的關(guān)鍵組成之一。該團(tuán)隊(duì)對208例惡性腫瘤患者的cfDNA進(jìn)行全基因組測序，作為對照，他們還對215名健康個(gè)體的cfDNA進(jìn)行了全基因組測序。這種被稱為DELFI (DNA evaluation of fragments for early interception) 的新技術(shù)通過利用獲取的cfDNA片段信息與參考人群進(jìn)行比較來篩查腫瘤。結(jié)果發(fā)現(xiàn)，DELFI對惡性腫瘤的檢出率達(dá)73%，特異性高達(dá)98%。該檢測還發(fā)現(xiàn)，在確定cfDNA的組織來源方面，準(zhǔn)確率為61%-75%。將DELFI和基于突變的cfDNA分析相結(jié)合，研究人員可以將檢測準(zhǔn)確度提高至91%。

這項(xiàng)創(chuàng)新技術(shù)為液體活檢應(yīng)用于惡性腫瘤的篩查帶來了新希望。 

我國科學(xué)家發(fā)現(xiàn)鼻咽癌EB病毒高危亞型

近日，中山大學(xué)腫瘤防治中心曾益新院士團(tuán)隊(duì)與合作伙伴共同努力，在EB病毒致癌研究領(lǐng)域取得了重要進(jìn)展：通過對來自鼻咽癌高發(fā)及低發(fā)區(qū)的EB病毒進(jìn)行全測序分析，發(fā)現(xiàn)了與鼻咽癌有關(guān)的高致病性EB病毒亞型。該高危亞型是迄今為止發(fā)現(xiàn)的與鼻咽癌發(fā)生相關(guān)的最大風(fēng)險(xiǎn)因素，對于研發(fā)鼻咽癌預(yù)防性疫苗及開展高危人群的早期篩查具有重要意義。該研究以題為“全基因組測序鑒定鼻咽癌相關(guān)的EB病毒高危亞型”于2019年6月17日以論文形式在頂級學(xué)術(shù)期刊《自然·遺傳》（Nature Genetics）發(fā)表。

該研究發(fā)現(xiàn)高于80%的鼻咽癌病例都感染了高危EB病毒亞型，因此，通過基因分型技術(shù)在人群中檢測是否攜帶高危亞型，結(jié)合發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測就能夠鎖定鼻咽癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)高的人群。目前，基于EB病毒高危亞型（EBV-BALF2分型）和曾益新院士科研團(tuán)隊(duì)在早前的研究中確立的7個(gè)和鼻咽癌發(fā)病密切相關(guān)的基因位點(diǎn)，開發(fā)了新一代鼻咽癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測芯片，已在中山大學(xué)腫瘤防治中心的分子診斷科和體檢中心作為院內(nèi)臨床檢驗(yàn)項(xiàng)目正式開展。對于有鼻咽癌家族史、攜帶EB病毒高危亞型和遺傳易感因素的高危人群，建議進(jìn)行定期鼻咽癌篩查，如血液中EB病毒抗體、鼻咽纖維鏡和頭頸MRI檢查，有望提高鼻咽癌早診率，從而治愈鼻咽癌，實(shí)現(xiàn)疾病的二級預(yù)防。

《柳葉刀》發(fā)表文章分析中國30年疾病負(fù)擔(dān)變化趨勢

近日，中國疾病預(yù)防控制中心、美國華盛頓大學(xué)等單位聯(lián)合開展研究，系統(tǒng)分析了我國1990年至2017年疾病負(fù)擔(dān)變化趨勢。相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表于國際頂尖期刊《柳葉刀》，論文標(biāo)題為“Mortality, morbidity and risk factors in China and its provinces, 1990—2017:a systematic analysis for the global burden of disease study 2017”。

研究結(jié)果顯示，2017年我國人群前五位主要死亡原因?yàn)橹酗L(fēng)、缺血性心臟病、肺癌、慢性阻塞性肺?。–OPD）和肝癌，而1990年為下呼吸道感染、新生兒疾病、中風(fēng)、COPD和交通事故。盡管中風(fēng)年齡標(biāo)化死亡率自1990年下降33.5%，但其仍為影響我國人群壽命的“頭號殺手”，而缺血性心臟病、肺癌排名分別由1990年的第7、13位躍升至2017年的第2、3位，其年齡標(biāo)化死亡率分別增加20.6%和28.2%。同時(shí)，在排名前25位的疾病中，與1990年相比，COPD、新生兒疾病、下呼吸道感染、自殘、肝硬化、其他慢性肝病、先天性出生缺陷和溺水年齡標(biāo)化死亡率下降50%之多。研究還發(fā)現(xiàn)，高血壓、吸煙、高鈉飲食、空氣污染、高血糖、高膽固醇、高體重指數(shù)、谷物蔬果攝入不足和飲酒是位列前十的死亡危險(xiǎn)因素。此外，疾病分布存在地區(qū)差異，東部、沿海地區(qū)與經(jīng)濟(jì)發(fā)達(dá)省份疾病負(fù)擔(dān)較小。

該研究結(jié)果反映，近30年我國與傳染性、孕產(chǎn)婦、新生兒和營養(yǎng)狀況相關(guān)的疾病負(fù)擔(dān)呈大幅下降趨勢，而非傳染性疾病導(dǎo)致的疫病負(fù)擔(dān)日益凸顯，提示未來公共衛(wèi)生政策應(yīng)優(yōu)先關(guān)注慢性疾病。  

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