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一圖讀懂一份核酸報(bào)告的誕生

一圖讀懂一份核酸報(bào)告的誕生

發(fā)布日期:2022-03-24 作者: 點(diǎn)擊:

這兩天,

經(jīng)歷了第一批“網(wǎng)格化”篩查的市民發(fā)現(xiàn),

有些小區(qū)已經(jīng)重新進(jìn)入“決賽圈”

有些研判下來(lái)還是有風(fēng)險(xiǎn)的,

則延長(zhǎng)了管控時(shí)間。

其中起到關(guān)鍵作用的,

是一份份核酸報(bào)告。


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對(duì)于市民來(lái)說(shuō),核酸檢測(cè)看似只有兩步:登記采樣,等待數(shù)小時(shí)后在健康云App上查詢(xún)結(jié)果。事實(shí)上,在這看似輕松的兩步背后,還凝聚了基因擴(kuò)增實(shí)驗(yàn)室(PCR實(shí)驗(yàn)室)檢驗(yàn)人員的大量工作。


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進(jìn)入PCR實(shí)驗(yàn)室必須“全副武裝”。新民晚報(bào)記者 徐程 攝(下同)


凌晨2時(shí),這座城市的萬(wàn)家燈火早已熄滅,而申城各家核酸檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室依舊燈火通明。一位位身著厚重防護(hù)服的檢驗(yàn)人員,正在實(shí)驗(yàn)臺(tái)前一絲不茍地進(jìn)行核酸樣本的檢測(cè),汗水不住地從額滲出,嘴里呼出的熱氣模糊了護(hù)目鏡。


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待檢測(cè)的核酸標(biāo)本堆了滿(mǎn)滿(mǎn)一桌子


采樣后,你的樣本經(jīng)歷了怎樣的“奇幻漂流”之旅?新民晚報(bào)記者近日走進(jìn)同濟(jì)大學(xué)附屬東方醫(yī)院南院檢驗(yàn)科PCR實(shí)驗(yàn)室,吳文娟主任為大家揭秘一份準(zhǔn)確的核酸報(bào)告是如何誕生的。


,時(shí)長(zhǎng)02:15



標(biāo)本擁有了“身份證”


“醫(yī)生,我今天在你們醫(yī)院做的核酸什么時(shí)候有結(jié)果呀?還要多久呀?”

“醫(yī)生,我急需核酸報(bào)告,能加急幫我檢測(cè)一下嗎?”


這幾天,申城各醫(yī)療機(jī)構(gòu)的醫(yī)務(wù)人員總會(huì)接到這樣的問(wèn)詢(xún)電話。很多人以為,核酸采樣后,直接用機(jī)器檢測(cè)很快就能出結(jié)果了。其實(shí),從采樣護(hù)士在你的鼻部或咽部“輕捻慢攏”后,后續(xù)還包括了樣本簽收、核酸提取、核酸轉(zhuǎn)移、核酸擴(kuò)增、結(jié)果審核等步驟。


核酸檢測(cè)樣本采集后,采集人員會(huì)清點(diǎn)數(shù)目,并用密封袋包裝好,用消毒劑噴灑消毒,然后放進(jìn)樣本轉(zhuǎn)運(yùn)箱,由專(zhuān)人送到核酸檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室。檢測(cè)人員收到樣本后會(huì)先對(duì)轉(zhuǎn)運(yùn)箱消毒,并在開(kāi)啟后對(duì)轉(zhuǎn)運(yùn)箱內(nèi)壁和標(biāo)本采集密封袋二次消毒,之后才是拆開(kāi)密封袋取出樣本。


“核酸的采集管上都有條碼信息,簽收人員要理清樣本來(lái)自哪一個(gè)社區(qū)或人群,是單采還是混采?!眳俏木瓯硎?,“另外,我們還會(huì)留意樣本上的時(shí)間,便于日后需要時(shí)回溯?!?/span>


之后,核酸樣本就將經(jīng)歷“奇幻漂流”的第二步——要有“身份證”啦!檢驗(yàn)人員則將這一步稱(chēng)為“樣本前處理”?!癙CR反應(yīng)是在96孔板上實(shí)現(xiàn)的,每一個(gè)孔位都有自己獨(dú)一無(wú)二的身份?!眳俏木暾f(shuō)。


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檢驗(yàn)人員為剛剛送到的樣本進(jìn)行編號(hào)和信息錄入工作


看似只是“前處理”,但防備之心可是一點(diǎn)兒也不能松。檢驗(yàn)人員要識(shí)別空管或溢灑情況的發(fā)生。尤其在大人群10:1混采時(shí),小小的試管被拭子擠滿(mǎn),一旦陽(yáng)性樣本出現(xiàn)了溢灑,一方面可能造成其他樣本結(jié)果的污染(假陽(yáng)性),另一方面對(duì)實(shí)驗(yàn)室的生物安全產(chǎn)生威脅——這也是PCR實(shí)驗(yàn)室的檢驗(yàn)人員同樣要穿成“大白”模樣的原因——醫(yī)用帽子、N95口罩、面屏、護(hù)目鏡、醫(yī)用防護(hù)服、隔離衣、一次性鞋套、兩層手套,這些“束縛”卻能給檢驗(yàn)人員創(chuàng)造最安全的環(huán)境。


此外,PCR實(shí)驗(yàn)室要求嚴(yán)格分區(qū),最好是負(fù)壓實(shí)驗(yàn)室??諝饬鲃?dòng)只會(huì)從外向內(nèi),那么實(shí)驗(yàn)室里的污染就不會(huì)擴(kuò)散到外界,可以保證實(shí)驗(yàn)室外面的安全。


與病毒“擦肩而過(guò)”或只有2毫米


拿到“身份證”的核酸樣本并不能直接測(cè)試,而是要先提取核酸,對(duì)其進(jìn)行擴(kuò)增。因此,核酸樣本“奇幻漂流”的下一站,是PCR加樣區(qū)——簡(jiǎn)單來(lái)說(shuō),檢驗(yàn)人員要把病毒的遺傳物質(zhì)(核糖核酸)給“揪出來(lái)”。


此時(shí),檢驗(yàn)人員戴著雙層手套,在生物安全柜內(nèi)一管一管地?cái)Q開(kāi)螺旋蓋,手工吸取樣本,加入核酸提取板孔中,再擰上螺旋蓋將標(biāo)本放回原處?!坝卸嗌俜輼颖揪陀卸嗌俅蔚闹貜?fù)操作。”吳文娟說(shuō)。那時(shí),檢驗(yàn)人員與新冠病毒“擦肩而過(guò)”的距離可能只隔著兩層乳膠手套——也就是2毫米,但核酸檢測(cè)工作不允許他們害怕。


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檢驗(yàn)人員正在進(jìn)行核酸提取環(huán)節(jié)中的加樣步驟


獲得核酸后,檢驗(yàn)人員用移液槍將核酸轉(zhuǎn)移至事先準(zhǔn)備好反應(yīng)液的反應(yīng)管里,制成反應(yīng)體系,讓它進(jìn)入“奇幻漂流”的下一站:擴(kuò)增分析區(qū)


“不能出錯(cuò),不能有遺漏,不能發(fā)生生物安全事故??梢哉f(shuō)檢驗(yàn)人員全身時(shí)刻處于高度緊張的狀態(tài)。就單說(shuō)‘加樣’,檢驗(yàn)人員要用極小的槍頭將每個(gè)提取好的核酸,大概是一滴水的四分之一加入到試劑中,每一步操作都必須十二分謹(jǐn)慎?!眳俏木旮嬖V記者,“我們迫切希望能有開(kāi)蓋、加樣的儀器來(lái)‘解放’檢驗(yàn)人員,可現(xiàn)有的儀器在速度上并不能令人滿(mǎn)意,遇上大樣本篩查只能靠手工操作。”


讓它變多才能檢測(cè)出來(lái)


經(jīng)歷了復(fù)雜費(fèi)時(shí)的前期制備過(guò)程,樣本終于來(lái)到了“奇幻漂流”的關(guān)鍵一站。樣本的采樣質(zhì)量如何、核酸提取的質(zhì)量如何、結(jié)果如何都將在此處見(jiàn)分曉。


這里不得不提一下曾斬獲諾貝爾獎(jiǎng)的聚合酶鏈反應(yīng)(PCR),這是20世紀(jì)80年代中期發(fā)展起來(lái)的一項(xiàng)體外核酸擴(kuò)增技術(shù),它可以將目標(biāo)基因片段于數(shù)小時(shí)內(nèi)擴(kuò)增百萬(wàn)倍至數(shù)億倍,成為當(dāng)今生命科學(xué)研究最為重要且廣泛使用的技術(shù)手段之一。


怎么理解擴(kuò)增?


如果把樣本提取出來(lái)的核酸看作是一塊土地,新冠病毒是種子,如何知道土地里有沒(méi)有種子?簡(jiǎn)單的方法是,加點(diǎn)水和肥料(試劑),讓種子一個(gè)變兩個(gè)、兩個(gè)變四個(gè)、四個(gè)變八個(gè)……“病毒是看不到的,而且微量樣本也不容易檢測(cè)到,所以要讓它變多,才方便檢測(cè)出來(lái)。”吳文娟解釋。


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經(jīng)過(guò)復(fù)雜的前期制備工作,才能在PCR儀上進(jìn)行擴(kuò)增檢測(cè)。上機(jī)后,就是歷時(shí)約1.5小時(shí)擴(kuò)增檢測(cè),而且中間不能有停頓、不能有斷電、不能有儀器故障,核酸檢測(cè)才能完成


當(dāng)反應(yīng)管在機(jī)器上開(kāi)始檢驗(yàn)后,也就意味著“開(kāi)弓沒(méi)有回頭箭”——從采樣到核酸制備任何一個(gè)環(huán)節(jié)出現(xiàn)問(wèn)題都可能導(dǎo)致返工重測(cè),從而使報(bào)告時(shí)間加倍。


3月15日,國(guó)家衛(wèi)健委發(fā)布《新型冠狀病毒肺炎診療方案(試行第九版)》。其中,《方案》將解除隔離管理和出院標(biāo)準(zhǔn)修改為“連續(xù)兩次新型冠狀病毒核酸檢測(cè)N基因和ORF基因CT值均≥35(熒光定量PCR方法,界限值為40,采樣時(shí)間至少間隔24小時(shí))”,這也讓很多“小白”知道,這兒的“CT”并非到醫(yī)院拍個(gè)CT,而是指擴(kuò)增的閾值。“簡(jiǎn)單來(lái)說(shuō), CT值越低,說(shuō)明陽(yáng)性越強(qiáng);CT值越高,說(shuō)明陽(yáng)性越弱。”


作為初篩實(shí)驗(yàn)室,只能向疾控中心報(bào)告“疑似陽(yáng)性”?!拔覀儠?huì)將CT值登記報(bào)告,上報(bào)相應(yīng)區(qū)域的疾控部門(mén)。隨后根據(jù)疾控的要求轉(zhuǎn)運(yùn)原管標(biāo)本以供復(fù)核?!眳俏木暾f(shuō),而PCR實(shí)驗(yàn)室也會(huì)通過(guò)紫外線消毒。據(jù)介紹,通常陰性樣本會(huì)儲(chǔ)存一兩天以備查驗(yàn)。


向你飛奔而來(lái)的報(bào)告背后是汗水


走到這,核酸樣本的“奇幻漂流”之旅并沒(méi)有結(jié)束。檢測(cè)人員需要對(duì)擴(kuò)增結(jié)果進(jìn)行分析:包括同批隨樣本檢測(cè)的陰陽(yáng)性質(zhì)控結(jié)果是否在控、基線設(shè)置、逐孔分析內(nèi)標(biāo)及樣本結(jié)果是否正常等。當(dāng)陰陽(yáng)性質(zhì)控全部符合檢測(cè)要求,排除假陰性、假陽(yáng)性可能,對(duì)異常結(jié)果樣本及時(shí)進(jìn)行復(fù)核,確保無(wú)誤后才能最終報(bào)告結(jié)果,并上傳到健康云。


有人好奇,健康云核酸結(jié)果查詢(xún)里,“OFR1a/b陰性,N基因陰性”是什么意思?吳文娟解釋?zhuān)?/span>這是新型冠狀病毒核酸的兩個(gè)特異性片段,“一般同一份標(biāo)本中兩個(gè)基因檢測(cè)結(jié)果均為陽(yáng)性,會(huì)判斷為陽(yáng)性,單基因陽(yáng)性則需復(fù)檢?!?/strong>


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這幾天,PCR實(shí)驗(yàn)室里的檢驗(yàn)人員都在超負(fù)荷工作


“現(xiàn)在我們檢驗(yàn)科的工作包括了‘愿檢盡檢’——市民需要核酸陰性報(bào)告這張‘通行證’的;‘應(yīng)檢盡檢’——住院患者和陪護(hù),還有醫(yī)院承擔(dān)的密接、次密接及高風(fēng)險(xiǎn)人群的核酸檢測(cè)。這幾天,還有網(wǎng)格化篩查的任務(wù)?!?/span>吳文娟的語(yǔ)氣里透露著疲憊。


那儀器運(yùn)行時(shí),檢測(cè)人員能輕松一會(huì)兒?jiǎn)幔坎⒉皇?,此時(shí),新的一批樣本又來(lái)了,又要開(kāi)始錄信息,提核酸,加樣……吳文娟說(shuō),隨著核酸樣本量不斷增大,檢驗(yàn)人員一直是在超負(fù)荷運(yùn)轉(zhuǎn)。


防護(hù)服是不透氣的,全身罩在里面,剛穿上就會(huì)很熱。加之機(jī)器一刻不停,熱量積聚一天后整個(gè)實(shí)驗(yàn)室會(huì)非常悶熱,即使開(kāi)著空調(diào)室內(nèi)溫度也會(huì)達(dá)到28-30℃。此外,實(shí)驗(yàn)室里靜電也很強(qiáng)烈,因此也特別干燥。”她說(shuō),“我們中的很多人已經(jīng)連續(xù)幾天都沒(méi)有回過(guò)家了,大家都是‘5+2’‘白+黑’的節(jié)奏在工作,能夠躺下來(lái)休息一會(huì),就覺(jué)得很滿(mǎn)足了。”


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